根据《西安市重点实验室认定管理办法》，成立实验室学术委员会和实验室管理委员会。实验室学术委员是由12名国内神经免疫疾病专家组成，主要职能是为重点实验室的建设目标和研究方向的确定与调整、重点实验室发展规划和年度工作计划、重大学术活动提供指导和建议。重点实验室管理实行医院领导下的主任负责制，设实验室主任1名，副主任3 名，设办公室负责实验室日常行政管理与对内外协调工作，实验室固定研究人员63名，固定技术人员14名，固定管理人员6名。
实验室组织机构框架如下：
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